Průkaz mikroorganizmů metodou polymerázové řetězové reakce (PCR)



Virové hepatitídy

RNA HCV (včetně kvantifikace)

Metoda: PCR

Indikace: monitorování replikace viru - úspěšnosti léčby

Materiál: srážlivá krev, sérum, plazma (EDTA krev), 2ml

Transport: při 4°C do 12 h od odběru

Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ < 600 IU/ml nebo např. 2E+5 IU/ml (200 000 IU/ml)

Výsledek do: 1 týdne, provádí se pouze u RNA HCV pozitivních vzorků

Kontakt: Oddělení imunologie a alergologie, tel.: 596 200 225

Genotyp HCV

Metoda: PCR

Indikace: stanovení genotypu HCV - podklad pro postup léčby

Materiál: srážlivá krev, sérum, plazma (EDTA krev), 2ml

Transport: při 4°C do 12 h od odběru

Forma výsledku: 1a/b, 2a/c, 2b, 3a, 4

Výsledek do: 2 týdnů, provádí se pouze u RNA HCV pozitivních vzorků

Kontakt: Oddělení imunologie a alergologie, tel.: 596 200 225

DNA HBV (včetně kvantifikace)

Metoda: PCR

Indikace: průkaz produktivní infekce HBV - stanovení replikace viru monitorování replikace viru - úspěšnosti léčby

Materiál: srážlivá krev, sérum, plazma (EDTA krev), 2ml

Transport: při 4°C do 12 h od odběru

Forma výsledku: NEGATIVNÍ, do 1E+05cp/ml slabě POZITIVNÍ + kvantita,
nad 1E+05cp/ml POZITIVNÍ + kvantita

Výsledek do: 1 týdne

Kontakt: Oddělení imunologie a alergologie, tel.: 596 200 225

Genotyp HBV

Metoda: PCR

Indikace: stanovení genotypu HBV - podklad pro postup léčby

Materiál: srážlivá krev, sérum, plazma (EDTA krev), 2ml

Transport: při 4°C do 12 h od odběru

Forma výsledku:typ A, B, C, D, E, F

Výsledek do: 1 měsíce

Kontakt: Oddělení imunologie a alergologie, tel.: 596 200 225

Precore HBV

Metoda: PCR

Indikace: podklad pro postup léčby, průkaz mutací v oblasti PreCore

Materiál: srážlivá krev, sérum, plazma (EDTA krev), 2ml

Transport: při 4°C do 12 h od odběru

Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ s komentářem

Výsledek do: 1 měsíce, provádí se pouze u DNA HBV pozitivních vzorků

Kontakt: Oddělení imunologie a alergologie, tel.: 596 200 225

BCP HBV

Metoda: PCR

Indikace: podklad pro postup léčby, průkaz mutací v oblasti Basal Core Promotor

Materiál: srážlivá krev, sérum, plazma (EDTA krev), 2ml

Transport: při 4°C do 12 h od odběru

Forma výsledku:NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ s komentářem

Výsledek do: 1 měsíce, provádí se pouze u DNA HBV pozitivních vzorků

Kontakt: Oddělení imunologie a alergologie, tel.: 596 200 225

Lékové rezistence HBV (lamivudin, adefovir, entecavir, telbivudin. emtricitabin, tenofovir)

Metoda: PCR

Indikace: podklad pro postup léčby, průkaz mutace v oblasti YMDD

Materiál: srážlivá krev, sérum, plazma (EDTA krev), 2ml

Transport: při 4°C do 12 h od odběru

Forma výsledku: CITLIVÝ REZISTENTNÍ s komentářem

Výsledek do: 1 měsíce, provádí se pouze u DNA HBV pozitivních vzorků

Kontakt: Oddělení imunologie a alergologie, tel.: 596 200 225

RNA HEV

Metoda: PCR

Indikace: průkaz produktivní infekce HEV

Materiál: srážlivá krev, sérum, plazma (EDTA krev), 2ml, stolice velikost lískového oříšku

Transport: při 4°C do 12 h od odběru

Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ

Výsledek do: 1 týdne

Kontakt: Oddělení imunologie a alergologie, tel.: 596 200 225

RNA HGV

Metoda: PCR

Indikace: průkaz produktivní infekce HGV - stanovení replikace viru

Materiál: srážlivá krev, sérum, plazma (EDTA krev), 2ml

Transport: při 4°C do 12 h od odběru

Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ

Výsledek do: 1 týdne

Kontakt: Oddělení imunologie a alergologie, tel.: 596 200 225



Herpetické viry

DNA CMV (včetně kvantifikace)

Metoda: PCR

Indikace: infekce herpetickými viry

Materiál: plazma (EDTA krev) 2ml, likvor 1,5ml, moč, plodová voda 2ml, stěr*

Transport: při 4°C do 12 h od odběru

Forma výsledku: 0 cp/ml (negativní), < 500 cp/ml nebo hodnota cp/ml (pozitivní)
např. 2E+5 cp/ml (200 000 cp/ml)

Výsledek do: 1 týdne (STATIM: možno vyšetřit téhož dne do 16:00, vzorek musí být do laboratoře dodán do 11:00)

Kontakt: Odd. virologie, tel.: 596 200 334, 341

* stěr na suchém (dakronovém, ne vatovém !) tampónu zalomit do sterilní zkumavky nebo použít běžná virová transportní média

DNA HSV1/2

Metoda: PCR

Indikace: infekce herpetickými viry

Materiál: plazma (EDTA krev) 2ml, likvor 1,5ml, stěr*

Transport: při 4°C do 12 h od odběru

Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ HSV1 nebo HSV2

Výsledek do: 1 týdne (STATIM: možno vyšetřit téhož dne do 16:00, vzorek musí být do laboratoře dodán do 11:00)

Kontakt: Odd. virologie, tel.: 596 200 334, 341

* stěr na suchém (dakronovém, ne vatovém !) tampónu zalomit do sterilní zkumavky nebo použít běžná virová transportní média

DNA EBV (včetně kvantifikace)

Metoda: PCR

Indikace: infekce herpetickými viry

Materiál: plazma (EDTA krev) 2ml, likvor 1,5ml

Transport: při 4°C do 12 h od odběru

Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ

Výsledek do: 1 týdne (STATIM: možno vyšetřit téhož dne do 16:00, vzorek musí být do laboratoře dodán do 11:00)

Kontakt: Odd. virologie, tel.: 596 200 334, 341

DNA VZV

Metoda: PCR

Indikace: infekce herpetickými viry

Materiál: plazma (EDTA krev) 2ml, likvor 1,5ml, stěr*

Transport: při 4°C do 12 h od odběru

Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ

Výsledek do: 1 týdne (STATIM: možno vyšetřit téhož dne do 16:00, vzorek musí být do laboratoře dodán do 11:00)

Kontakt: Odd. virologie, tel.: 596 200 334, 341

* stěr na suchém (dakronovém, ne vatovém !) tampónu zalomit do sterilní zkumavky nebo použít běžná virová transportní média

DNA HHV6 (včetně kvantifikace)

Metoda: PCR

Indikace: infekce herpetickými viry

Materiál: plazma (EDTA krev) 2ml, likvor 1,5ml

Transport: při 4°C do 12 h od odběru

Forma výsledku:0 cp/ml (negativní), < 500 cp/ml nebo hodnota cp/ml (pozitivní)
např. 2E+5 cp/ml (200 000 cp/ml)

Výsledek do: 1 týdne (STATIM: možno vyšetřit téhož dne do 16:00, vzorek musí být do laboratoře dodán do 11:00)

Kontakt: Odd. virologie, tel.: 596 200 334, 341



Respirační viry

RNA Influenza A, B

Metoda: PCR

Indikace: respirační infekce

Materiál: výtěr z nosu a krku *

Transport: Při 4°C, do 12 h po odběru

Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ Influenza A nebo Influenza B

Výsledek do:1 týdne (STATIM: možno vyšetřit téhož dne do 16:00, vzorek musí být do laboratoře dodán do 11:00)

Kontakt: Odd. virologie, tel.: 596 200 334, 341

* stěr na dakronovém (ne vatovém !) tampónu zalomit do zkumavky s virovým transportním médiem nebo médiem eSwab

RNA Influenza A – typizace (H1N1 2009, H1, H3)

Metoda: PCR

Indikace: respirační infekce

Materiál: výtěr z nosu a krku *

Transport: Při 4°C, do 12 h po odběru

Forma výsledku: Influenza A (H1N1 2009), Influenza A (H1N1), Influenza A (H3N2)

Výsledek do:1 týdne (STATIM: možno vyšetřit téhož dne do 16:00, vzorek musí být do laboratoře dodán do 11:00)

Kontakt: Odd. virologie, tel.: 596 200 334, 341

* stěr na dakronovém (ne vatovém !) tampónu zalomit do zkumavky s virovým transportním médiem nebo médiem eSwab

RNA Parainfluenza 1, 2, 3

Metoda: PCR

Indikace: respirační infekce

Materiál: výtěr z nosu a krku *

Transport: Při 4°C, do 12 h po odběru

Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ Parainfluenza 1, 2 nebo 3

Výsledek do:1 týdne

Kontakt: Odd. virologie, tel.: 596 200 334, 341

* stěr na dakronovém (ne vatovém !) tampónu zalomit do zkumavky s virovým transportním médiem nebo médiem eSwab

RNA RSV A, B

Metoda: PCR

Indikace: respirační infekce

Materiál: výtěr z nosu a krku *

Transport: Při 4°C, do 12 h po odběru

Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ RSV A nebo RSV B

Výsledek do: 1 týdne (STATIM: možno vyšetřit téhož dne do 16:00, vzorek musí být do laboratoře dodán do 11:00)

Kontakt: Odd. virologie, tel.: 596 200 334, 341

* stěr na dakronovém (ne vatovém !) tampónu zalomit do zkumavky s virovým transportním médiem nebo médiem eSwab

RNA Human metapneumovirus

Metoda: PCR

Indikace: respirační infekce

Materiál: výtěr z nosu a krku *

Transport: Při 4°C, do 12 h po odběru

Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ

Výsledek do: 1 týdne (STATIM: možno vyšetřit téhož dne do 16:00, vzorek musí být do laboratoře dodán do 11:00)

Kontakt: Odd. virologie, tel.: 596 200 334, 341

* stěr na dakronovém (ne vatovém !) tampónu zalomit do zkumavky s virovým transportním médiem nebo médiem eSwab

RNA Coronavirus (229E, NL63, OC43, HKU1)

Metoda: PCR

Indikace: respirační infekce

Materiál: výtěr z nosu a krku *

Transport: Při 4°C, do 12 h po odběru

Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ

Výsledek do: 1 týdne (STATIM: možno vyšetřit téhož dne do 16:00, vzorek musí být do laboratoře dodán do 11:00)

Kontakt: Odd. virologie, tel.: 596 200 334, 341

* stěr na dakronovém (ne vatovém !) tampónu zalomit do zkumavky s virovým transportním médiem nebo médiem eSwab

RNA Rhinovirus

Metoda: PCR

Indikace: respirační infekce

Materiál: výtěr z nosu a krku *

Transport: Při 4°C, do 12 h po odběru

Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ

Výsledek do: 1 týdne (STATIM: možno vyšetřit téhož dne do 16:00, vzorek musí být do laboratoře dodán do 11:00)

Kontakt: Odd. virologie, tel.: 596 200 334, 341

* stěr na dakronovém (ne vatovém !) tampónu zalomit do zkumavky s virovým transportním médiem nebo médiem eSwab

DNA Bocavirus

Metoda: PCR

Indikace: respirační infekce

Materiál: výtěr z nosu a krku *

Transport: Při 4°C, do 12 h po odběru

Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ

Výsledek do: 1 týdne (STATIM: možno vyšetřit téhož dne do 16:00, vzorek musí být do laboratoře dodán do 11:00)

Kontakt: Odd. virologie, tel.: 596 200 334, 341

* stěr na dakronovém (ne vatovém !) tampónu zalomit do zkumavky s virovým transportním médiem nebo médiem eSwab



Arboviry

RNA TBEV (virus klíšťové encefalitidy)

Metoda: PCR

Indikace: klíšťová encefalitida

Materiál: srážlivá krev, sérum, plazma (EDTA krev) 2ml, likvor 0,5ml

Transport: Při 4°C, do 12 h po odběru

Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ

Výsledek do: 1 týdne (STATIM: možno vyšetřit téhož dne do 16:00, vzorek musí být do laboratoře dodán do 11:00)

Kontakt: Odd. virologie, tel.: 596 200 334, 341

RNA West Nile virus

Metoda: PCR

Indikace: západonilská horečka

Materiál: likvor min.1,5ml, sérum, plazma (EDTA krev) 2ml

Transport: při 4°C do 12 h od odběru

Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ

Výsledek do: 1 týdne (STATIM: možno vyšetřit téhož dne do 16:00, vzorek musí být do laboratoře dodán do 11:00)

Kontakt: Odd. virologie, tel.: 596 200 334, 341

RNA Hantavirus

Metoda: PCR

Indikace: hemoragická horečka s ledvinovým syndromem

Materiál: srážlivá krev, sérum, plazma (EDTA krev) 2ml

Transport: při 4°C do 12 h od odběru

Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ

Výsledek do: 1 týdne (STATIM: možno vyšetřit téhož dne do 16:00, vzorek musí být do laboratoře dodán do 11:00)

Kontakt: Odd. virologie, tel.: 596 200 334, 341

RNA Alphavirus

Metoda: PCR

Indikace:

Materiál: srážlivá krev, sérum, plazma (EDTA krev) 2ml, likvor 0,5ml

Transport: při 4°C do 12 h od odběru

Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ

Výsledek do: 1 týdne

Kontakt: Odd. virologie, tel.: 596 200 334, 341

RNA Dengue virus

Metoda: PCR

Indikace: horečka dengue

Materiál: srážlivá krev, sérum, plazma (EDTA krev) 2ml

Transport: při 4°C do 12 h od odběru

Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ

Výsledek do: 1 týdne (STATIM: možno vyšetřit téhož dne do 16:00, vzorek musí být do laboratoře dodán do 11:00)

Kontakt: Odd. virologie, tel.: 596 200 334, 341



Virové gastroenteritidy

RNA Rotavirus

Metoda: PCR

Indikace: virová gastroenteridita

Materiál: stolice velikost lískového oříšku

Transport: při 4°C do 12h od odběru

Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ

Výsledek do: 1 týdne (STATIM: možno vyšetřit téhož dne do 16:00, vzorek musí být do laboratoře dodán do 11:00)

Kontakt: Odd. virologie, tel.: 596 200 334, 341

RNA Norovirus

Metoda: PCR

Indikace: virová gastroenteridita

Materiál: stolice velikost lískového oříšku

Transport: při 4°C do 12h od odběru

Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ

Výsledek do: 1 týdne (STATIM: možno vyšetřit téhož dne do 16:00, vzorek musí být do laboratoře dodán do 11:00)

Kontakt: Odd. virologie, tel.: 596 200 334, 341

RNA Astrovirus

Metoda: PCR

Indikace: virová gastroenteridita

Materiál: stolice velikost lískového oříšku

Transport: při 4°C do 12h od odběru

Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ

Výsledek do: 1 týdne (STATIM: možno vyšetřit téhož dne do 16:00, vzorek musí být do laboratoře dodán do 11:00)

Kontakt: Odd. virologie, tel.: 596 200 334, 341

RNA Sapovirus

Metoda: PCR

Indikace: virová gastroenteridita

Materiál: stolice velikost lískového oříšku

Transport: při 4°C do 12h od odběru

Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ

Výsledek do: 1 týdne (STATIM: možno vyšetřit téhož dne do 16:00, vzorek musí být do laboratoře dodán do 11:00)

Kontakt: Odd. virologie, tel.: 596 200 334, 341

RNA Parechovirus

Metoda: PCR

Indikace: virová gastroenteridita, infekce CNS, respirační infekce, myokarditidy

Materiál: stolice velikost lískového oříšku, likvor min. 1,5ml, výtěr z nosu a krku*, plazma (EDTA krev) 2ml

Transport: při 4°C do 12h od odběru

Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ

Výsledek do: 1 týdne (STATIM: možno vyšetřit téhož dne do 16:00, vzorek musí být do laboratoře dodán do 11:00)

Kontakt: Odd. virologie, tel.: 596 200 334, 341

* stěr na dakronovém (ne vatovém !) tampónu zalomit do zkumavky s virovým transportním médiem nebo médiem eSwab



Ostatní viry

RNA Enterovirus

Metoda: PCR

Indikace: aseptické meningitidy a encefalitidy, respirační infekce

Materiál: plazma (EDTA krev) 2ml, likvor 1,0ml, stěr*, stolice velikost lískového oříšku, výtěr z nosu a krku*

Transport: při 4°C do 12h od odběru

Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ

Výsledek do: 1 týdne (STATIM: možno vyšetřit téhož dne do 16:00, vzorek musí být do laboratoře dodán do 11:00)

Kontakt: Odd. virologie, tel.: 596 200 334, 341

* stěr na dakronovém (ne vatovém !) tampónu zalomit do zkumavky s virovým transportním médiem nebo médiem eSwab

DNA Parvovirus B19 (včetně kvantifikace)

Metoda: PCR

Indikace: pátá nemoc

Materiál: srážlivá krev, sérum, plazma (EDTA krev) 2ml

Transport: při 4°C do 12h od odběru

Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ

Výsledek do: 1 týdne

Kontakt: Odd. virologie, tel.: 596 200 334, 341

RNA Parotitis

Metoda: PCR

Indikace: příušnice

Materiál:výtěr bukální sliznice*, sliny, moč, likvor 1,0ml

Transport: při 4°C do 12h od odběru

Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ

Výsledek do: 1 týdne

Kontakt: Odd. virologie, tel.: 596 200 334, 341

* stěr na dakronovém (ne vatovém !) tampónu zalomit do zkumavky s virovým transportním médiem nebo médiem eSwab

DNA Adenovirus

Metoda: PCR

Indikace: keratokonjuktivitida, respirační infekce

Materiál:výtěr/ stěr*

Transport: při 4°C do 12h od odběru

Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ

Výsledek do: 1 týdne (STATIM: možno vyšetřit téhož dne do 16:00, vzorek musí být do laboratoře dodán do 11:00)

Kontakt: Odd. virologie, tel.: 596 200 334, 341

* stěr na suchém (dakronovém, ne vatovém !) tampónu zalomit do sterilní zkumavky nebo použít běžná virová transportní média

DNA BK virus (včetně kvantifikace)

Metoda: PCR

Indikace: BK virová nefropatie u pacientů po transplantaci ledvin

Materiál:plazma (EDTA krev) 2ml, moč 2ml

Transport: při 4°C do 12h od odběru

Forma výsledku: 0 cp/ml (negativní), < 500 cp/ml nebo hodnota cp/ml (pozitivní) např. 2E+5 cp/ml (200 000 cp/ml)

Výsledek do: 1 týdne (STATIM: možno vyšetřit téhož dne do 16:00, vzorek musí být do laboratoře dodán do 11:00)

Kontakt: Odd. virologie, tel.: 596 200 334, 341

DNA JC virus

Metoda: PCR

Indikace: multifokální leukoencefalopatie

Materiál: likvor 1ml

Transport: při 4°C do 12h od odběru

Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ

Výsledek do: 1 týdne (STATIM: možno vyšetřit téhož dne do 16:00, vzorek musí být do laboratoře dodán do 11:00)

Kontakt: Odd. virologie, tel.: 596 200 334, 341



Sexuálně přenosná onemocnění

DNA Chlamydia trachomatis

Metoda: genová sonda, PCR

Indikace: onemocnění urogenitálního systému, konjuktivitidy

Materiál: Genová sonda: výtěr z uretry, spojivky (souprava Gen-Probe), výtěr z cervixu (souprava Digene)

PCR: moč, punktáty, výtěr dakronovým* tampónem nebo kartáčkem

Transport: Genová sonda: Při 2-25°C, do 14 dní

PCR: první porce moče minimálně 2 h po předchozím močení - uchování a transport při 4 C do 48 h, bez chlazení do 12 h od odběru.

Forma výsledku: Genová sonda: NEGATIVNÍ, SUSPEKTNÍ, POZITIVNÍ (hranice pozitivity: 300)

PCR: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ

Výsledek do: Genová sonda: 3 dnů

PCR: 1 týdne

Kontakt: Odd. virologie, tel.: 596 200 310, 311, 316

* odběrová souprava eSwab

DNA Neisseria gonorrhoeae

Metoda: genová sonda, PCR

Indikace: onemocnění urogenitálního systému, konjuktivitidy

Materiál: Genová sonda: výtěr z uretry, spojivky (souprava Gen-Probe), výtěr z cervixu (souprava Digene)

PCR: moč, výtěr dakronovým* tampónem nebo kartáčkem

Transport: Genová sonda: Při 2-25°C, do 14 dní

PCR: první porce moče minimálně 2 h po předchozím močení - uchování a transport při 4 C do 48 h, bez chlazení do 12 h od odběru.

Forma výsledku: Genová sonda: NEGATIVNÍ, SUSPEKTNÍ, POZITIVNÍ (hranice pozitivity: 300)

PCR: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ

Výsledek do: Genová sonda: 3 dnů

PCR: 1 týdne

Kontakt: Odd. virologie, tel.: 596 200 310, 311, 316

* odběrová souprava eSwab

DNA Mycoplasma genitalium

Metoda: PCR

Indikace: onemocnění urogenitálního systému

Materiál: moč, výtěr z uretry dakronovým tampónem*

Transport: první porce moče minimálně 2 h po předchozím močení - uchování a transport při 4 C do 48 h, bez chlazení do 12 h od odběru.

Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ

Výsledek do: 1 týdne

Kontakt: Odd. virologie, tel.: 596 200 310, 311, 316

* odběrová souprava eSwab

DNA Mycoplasma hominis

Metoda: PCR

Indikace: onemocnění urogenitálního systému, jiné infekce

Materiál: moč 20ml, výtěr z uretry nebo cervixu dakronovým tampónem*, likvor 1ml, BAL , sputum min. 2ml, punktát 1ml, krev (EDTA) 4ml

Transport: první porce moče minimálně 2 h po předchozím močení - uchování a transport při 4 C do 48 h, bez chlazení do 12 h od odběru.

Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ

Výsledek do: 1 týdne

Kontakt: Odd. molekulární biologie, tel.: 596 200 241, 147, 266
Oddělení bakteriologie a mykologie, Laboratoř fluorů a STI

* odběrová souprava eSwab

DNA Ureaplasma urealtyticum / parvum

Metoda: PCR

Indikace: onemocnění urogenitálního systému, jiné infekce

Materiál: moč 20ml, výtěr z uretry nebo cervixu dakronovým tampónem*, likvor 1ml, BAL , sputum min. 2ml, punktát 1ml, krev (EDTA) 4ml

Transport: první porce moče minimálně 2 h po předchozím močení - uchování a transport při 4 C do 48 h, bez chlazení do 12 h od odběru.

Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ

Výsledek do: 1 týdne

Kontakt: Odd. molekulární biologie, tel.: 596 200 241, 147, 266
Oddělení bakteriologie a mykologie, Laboratoř fluorů a STI

* odběrová souprava eSwab

DNA Trichomonas vaginalis

Metoda: PCR

Indikace: onemocnění urogenitálního systému

Materiál: moč 20ml, výtěr z pochvy dakronovým tampónem

Transport: první porce moče minimálně 2 h po předchozím močení - uchování a transport při 4 C do 48 h, bez chlazení do 12 h od odběru.

Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ

Výsledek do: 1 týdne

Kontakt: Odd. molekulární biologie, tel.: 596 200 241, 147, 266
Oddělení parazitologie a lékařské zoologie Ostrava, tel.: 596 200 326, 240

* odběrová souprava eSwab

DNA HPV high risk, low risk

Metoda: genová sonda

Indikace: cervikální léze

Materiál: výtěr z cervixu (souprava Digene)

Transport: Při 2-25°C, do 14 dní

Forma výsledku: NEGATIVNÍ, SUSPEKTNÍ, POZITIVNÍ (hranice pozitivity: 300)

Výsledek do: 3 dnů

Kontakt: Odd. virologie, tel.: 596 200 310, 311, 316



Mykobakteria

DNA Mycobacterium tuberculosis

Metoda: PCR z klinických vzorků

Indikace: podezření na TBC

Materiál: krev nesrážlivá 4ml (natricum citricum 3,8% + krev v poměru 1:4), laryngeální výtěr 6 tamp., vzorky z bronchoskopie 3x3x1 mm, moč 50ml, stolice velikostlískového ořechu, sputum, likvor, pleurální punktát, aspirát a další 2ml

Transport: při 4°C až pokojové teplotě max. 1den

Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ

Výsledek do: 2 až 7 pracovních dnů

Kontakt: Oddělení bakteriologie a mykologie Ostrava, tel.: 596 200 220, 223

RNA Mycobacterium tuberculosis complex

Metoda: MTD z klinických vzorků

Indikace: podezření na TBC

Materiál: laryngeální výtěr 6 tamp., vzorky z bronchoskopie 3x3x1 mm, moč 50ml, stolice velikostlískového ořechu, sputum, likvor, pleurální punktát, aspirát a další 2ml

Transport: při 4°C až pokojové teplotě max. 1den

Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ

Výsledek do: 2 až 7 pracovních dnů

Kontakt: Oddělení bakteriologie a mykologie Ostrava, tel.: 596 200 220, 223

DNA M. kansasii

Metoda: genová sonda, kmen získaný kultivačním vyšetřením

Indikace: určení mykobakteriálního druhu

Materiál: izolovaný kmen

Forma výsledku: prokázáno M. kansasii

Výsledek do: závisí na době izolování kmene (10 a více dní)

Kontakt: Oddělení bakteriologie a mykologie Ostrava, tel.: 596 200 220, 223

DNA M. gordonae

Metoda: genová sonda, kmen získaný kultivačním vyšetřením

Indikace: určení mykobakteriálního druhu

Materiál: izolovaný kmen

Forma výsledku: prokázáno M. gordonae

Výsledek do: závisí na době izolování kmene (10 a více dní)

Kontakt: Oddělení bakteriologie a mykologie Ostrava, tel.: 596 200 220, 223

DNA M. avium – intracellulare complex

Metoda: genová sonda, kmen získaný kultivačním vyšetřením

Indikace: určení mykobakteriálního kmene

Materiál: izolovaný kmen

Forma výsledku: prokázán komplex M.avium - intracellulare

Výsledek do: závisí na době izolování kmene (10 a více dní)

Kontakt: Oddělení bakteriologie a mykologie Ostrava, tel.: 596 200 220, 223

DNA M. avium

Metoda: genová sonda, kmen získaný kultivačním vyšetřením

Indikace: určení mykobakteriálního druhu

Materiál: izolovaný kmen

Forma výsledku: prokázáno M. avium

Výsledek do: závisí na době izolování kmene (10 a více dní)

Kontakt: Oddělení bakteriologie a mykologie Ostrava, tel.: 596 200 220, 223

DNA M. intracellulare

Metoda: genová sonda, kmen získaný kultivačním vyšetřením

Indikace: určení mykobakteriálního druhu

Materiál: izolovaný kmen

Forma výsledku: prokázáno M. intracellulare

Výsledek do: závisí na době izolování kmene (10 a více dní)

Kontakt: Oddělení bakteriologie a mykologie Ostrava, tel.: 596 200 220, 223



Bakteriální meningitidy

Bakteriální meningitidy

DNA N. meningitidis
DNA N. meningitidis typizace B,C
DNA S. pneumoniae
DNA H. influenzae
DNA L. monocytogenes

Metoda: PCR

Indikace: bakteriální meningitidy

Materiál: likvor 0,5 - 1 ml, plná krev (EDTA nebo citrátová) 5 ml. Materiál odeberte pouze pro vyšetření DNA!!!, sterilně do umělohmotné šroubovací zkumavky. Pro bakteriologické kultivační vyšetření odeberte druhý vzorek.

Transport: likvor při 4°C, krev při pokojové teplotě do 12 h od odběru, nad 12 h od odběru likvor zamražen a krev při 4°C

Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ

Kontakt: Odd. bakteriologie tel.: 596 200 179, 425



Atypické pneumonie

DNA Legionella pneumophila

Metoda: PCR

Indikace: atypická pneumonie

Materiál: BAL, sputum, tracheální aspirát, bronchiální sekret, pleurální výpotek min. 2ml

Transport: při 4°C do 12 h od odběru

Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ

Výsledek do: týdne

Kontakt: Oddělení bakteriologie tel.: 596 200 425, 328
Oddělení imunologie tel.: 596 200 225

DNA Mycoplasma pneumoniae

Metoda: PCR

Indikace: atypická pneumonie

Materiál: BAL, sputum, pleurální výpotek min. 2ml

Transport: při 4°C do 12 h od odběru

Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ

Výsledek do: týdne

Kontakt: Odd. bakteriologie tel.: 596 200 425, 328
Odd. virologie, tel.: 596 200 334, 341

DNA Chlamydia pneumoniae

Metoda: PCR

Indikace: atypická pneumonie

Materiál: BAL, sputum, pleurální výpotek min. 2ml

Transport: při 4°C do 12 h od odběru

Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ

Výsledek do: týdne

Kontakt: Odd. bakteriologie tel.: 596 200 425, 328
Odd. virologie, tel.: 596 200 334, 341



Sepse

G+ hemokultury - identifikace

Metoda: PCR

Indikace: sepse

Materiál: signál pozitivní hemokultura min. 1ml

Transport: při lab °C do 48 h od odběru

Forma výsledku: druhová identifikace

Výsledek do: denně

Kontakt: Oddělení bakteriologie a mykologie Ostrava, tel: 596 200 425, 328

G- hemokultury - identifikace

Metoda: PCR

Indikace: sepse

Materiál: signál pozitivní hemokultura min. 1ml

Transport: při lab °C do 48 h od odběru

Forma výsledku: druhová identifikace

Výsledek do: denně

Kontakt: Oddělení bakteriologie a mykologie Ostrava, tel: 596 200 425, 328



Ostatní bakterie

DNA Borrelia burgdorferi

Metoda: PCR

Indikace: podezření na boreliózu

Materiál: likvor min.1,5ml, punktát min. 1,5ml, moč, plazma (EDTA krev) 2ml

Transport: při 4°C do 12 h od odběru

Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ

Výsledek do: týdne

Kontakt: Oddělení parazitologie a lékařské zoologie Ostrava, tel.: 596 200 326, 240

Druhová identifikace Borrelia burgdorferi sensu stricto / afzelii / garini

Metoda: PCR RFLP

Indikace: borelióza

Materiál:likvor min.1,5ml, punktát min. 1,5ml, moč, plazma (EDTA krev) 2ml

Transport: při 4°C do 12 h od odběru

Forma výsledku: druhová identifikace

Výsledek do: 2 týdnů

Kontakt: Oddělení parazitologie a lékařské zoologie Ostrava, tel.: 596 200 326, 240

DNA Bordetella pertusis

Metoda: PCR

Indikace: dávivý kašel

Materiál:nasofaryngeální výtěr*

Transport: při 4°C do 12 h od odběru

Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ

Výsledek do: 1 týdne (STATIM: možno vyšetřit téhož dne do 16:00, vzorek musí být do laboratoře dodán do 11:00)

Kontakt: Oddělení bakteriologie a mykologie Ostrava, tel: 596 200 425, 328 Oddělení imunologie a alergologie, tel.: 596 200 225

* stěr na dakronovém (ne vatovém !) tampónu zalomit do zkumavky s médiem eSwab

DNA Bordetella parapertusis

Metoda: PCR

Indikace: dávivý kašel

Materiál: nasofaryngeální výtěr*

Transport: při 4°C do 12 h od odběru

Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ

Výsledek do: 1 týdne (STATIM: možno vyšetřit téhož dne do 16:00, vzorek musí být do laboratoře dodán do 11:00)

Kontakt: Oddělení bakteriologie a mykologie Ostrava, tel: 596 200 425, 328 Oddělení imunologie a alergologie, tel.: 596 200 225

* stěr na dakronovém (ne vatovém !) tampónu zalomit do zkumavky s médiem eSwab

DNA Helicobacter pylori

Metoda: PCR

Indikace:

Materiál:biopsie

Transport: při 4°C do 12 h od odběru

Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ

Výsledek do: týdne

Kontakt: Oddělení bakteriologie a mykologie Ostrava, tel: 596 200 425, 328 Oddělení imunologie a alergologie, tel.: 596 200 225

Průkaz toxinů A, B Clostridium difficile

Metoda: PCR

Indikace: pseudomembránová kolitida

Materiál: bakteriální kmen

Transport: při lab°C do 48 h od odběru

Forma výsledku: A-/B-, A-/B+, A+/B+

Výsledek do: 2 týdnů

Kontakt: Oddělení bakteriologie a mykologie Ostrava, tel: 596 200 425, 328

DNA Leptospira sp.

Metoda: PCR

Indikace: leptospiróza

Materiál: plazma (EDTA krev) 2ml, likvor min.1,5ml, moč, sklivec, biopsie

Transport: při 4°C do 12 h od odběru

Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ

Výsledek do: týdne (STATIM: možno vyšetřit téhož dne do 16:00, vzorek musí být do laboratoře dodán do 11:00)

Kontakt: Oddělení parazitologie a lékařské zoologie Ostrava, tel.: 596 200 326, 240



Houby

DNA Pneumocystis jirovecii

Metoda: PCR

Indikace: pneumonie

Materiál: BAL, sputum min. 2ml

Transport: při 4°C do 12h od odběru

Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ

Výsledek do: týdne

Kontakt: Oddělení bakteriologie a mykologie Ostrava tel.: 596 200 425, 328

DNA Mukormycety

Metoda: PCR

Indikace: invazivní mykotické onemocnění

Materiál: BAL, sputum min. 2ml, likvor min. 1,5ml, biopsie

Transport: při 4°C do 12h od odběru

Forma výsledku: NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ

Výsledek do: týdne

Kontakt: Oddělení bakteriologie a mykologie Ostrava tel.: 596 200 425, 328



Sekvenace

Sekvenační identifikace baktérií (16S DNA)

Metoda: sekvenování

Materiál: bakterialní kmen

Transport: při lab°C do 48 h od odběru

Forma výsledku: druhová identifikace

Výsledek do: 2 týdnů

Kontakt: Oddělení molekulární biologie, tel: 596 200 266, 241, 225

Sekvenační identifikace hub (benA, ITS2)

Metoda: sekvenování

Materiál: bakterialní kmen

Transport: při lab°C do 48 h od odběru

Forma výsledku: druhová identifikace

Výsledek do: 2 týdnů

Kontakt: Oddělení molekulární biologie, tel: 596 200 266, 241, 225

Sekvenační identifikace Legionella species (MIP)

Metoda: sekvenování

Materiál: bakterialní kmen

Transport: při lab°C do 48 h od odběru

Forma výsledku: druhová identifikace

Výsledek do: 2 týdnů

Kontakt: Oddělení molekulární biologie, tel: 596 200 266, 241, 225

Sekvenační subtypizace Legionella penumophila

Metoda: sekvenování

Materiál: bakterialní kmen

Transport: při lab°C do 48 h od odběru

Forma výsledku: SBT typ

Výsledek do: 1 měsíce

Kontakt: Oddělení molekulární biologie, tel: 596 200 266, 241, 225



Lidský genom

CELIAKIE – rizikové HLA alely

Metoda: PCR

Indikace: vyšetření genetické dispozice pro celiakii – nepřítomnost heterodimeru
HLA DQA1*0501/DQB1*0201 (DQ2) vylučuje celiakii na 95%
HLA DQA1*0301/DQB1*0302 (DQ8)

Materiál: EDTA krev, 2ml

Transport: při 4°C do 12h od odběru

Forma výsledku:NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ s komentářem

Výsledek do: 14 dnů

Kontakt: Oddělení imunologie a alergologie, tel.: 596 200 225

HLA B27

Metoda: PCR

Indikace: vyšetření genetické dispozice pro onemocnění, indikací k vyšetření je jednostranná uveitis přední oční komory často spojená s bolestí zad, rodinná anamnéza a revmatické onemocnění, Bechtěrevova nemoc

Materiál: EDTA krev, 2ml

Transport: při 4°C do 12h od odběru

Forma výsledku:NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ s komentářem

Výsledek do: 14 dnů

Kontakt: Oddělení imunologie a alergologie, tel.: 596 200 225

Intolerance laktózy

Metoda: PCR

Indikace: vyšetření genetické dispozice pro intoleranci laktózy určení jednonukleotidových polymorfizmů 13910 a 22018

Materiál: EDTA krev, 2ml

Transport: při 4°C do 12h od odběru

Forma výsledku:NEGATIVNÍ, POZITIVNÍ s komentářem

Výsledek do: 1 měsíce

Kontakt: Oddělení imunologie a alergologie, tel.: 596 200 225

Služby
klinických laboratoří
 
Zdravotní ústav se sídlem v Ostravě
Partyzánské náměstí 2633/7, Moravská Ostrava, 702 00 Ostrava,
tel.: 596 200 111, fax: 596 118 661, podatelna@zuova.cz,
Datová schránka: pubj9r8